游戏的架构大体延续上一代的变形金刚游戏。移动还是简单的WSAD模式，F为切换变身，鼠标左右键则是攻击和瞄准切换，R为装弹
第一章则是从大黄蜂的视角开始，一行人驾驶方舟准备从黑洞前往另一个空间。而不甘失败的威震天带领手下追上了方舟并且进行了猛烈的袭击
而之后你的任务就是协助大家抵抗威震天。第一关很简单，算是基础的教学关卡
现实移动鼠标完成调整视角的教学，然后按鼠标左键射击驾驶室的几个敌人之后。推进剧情，抵挡住驾驶室的袭击之后，按E拿取能量源重新激活电梯系统
第一关整体流程不是太复杂。游戏比较贴心的一点是，在每个阶段过后，会提示你是否对于目前的键位设定感到适宜
消灭沿路的敌人，按鼠标滚轮可以切换目前装备的武器。按F可以切换到变身模式，在变身模式下鼠标左键为攻击右键为加速
来到最后的平台，大黄蜂为擎天柱挡住了威震天的巨炮攻击。之后故事开始倒叙整个的剧情
由于多年塞伯坦的内战，以及使得塞伯坦的内核严重崩溃，无法继续生存下去。擎天柱故而决定带着剩余的博派建造方舟离开家园，去寻找新的世界
第二幕
同前作一样，关卡之间是无缝连接的。玩家可以通过LOADING的画面和剧情动画的出现而判断是否进入到下一章节
剧情由第一章开始倒叙整个故事。此时博派正在建造方舟，威震天带领手下倾巢出动攻击方舟，无奈之下，擎天柱只好一路前往保护方舟的路途。
由于威震天的突然袭击以及长久塞伯坦内战的消耗，博派一败涂地。擎天柱一路帮助各个地区恢复能量攻击，一路前往开启整个防区炮塔的路途
第二幕也算比较基础的游戏教程。从这里开始，玩家可以在每个关卡出现的地方，由杀死敌人而获得的金钱进行武器和个人属性的升级
每个游戏可升级的部位都是固定的，其中被锁住的升级点需要解锁所有的可升级点之后才能解锁。而且新出现的武器，玩家需要在商店进行购买之后才能在以后的游戏商店中进行装备使用
不过从实战的角度而言，实际上每个节点玩家只需要找到恰当的站位以及武器配置就可以了。武器和属性升级基本都是次要的，但是一些加护盾和血量的属性升级是优先的
来到第一个作战场景。先从左边的平台饶下，袭击敌人的后方，之后联通正面进攻的大部队一起剿灭这些敌人。
由于本作的设定，玩家切不可在没有任何掩护或者友军吸引火力的情况下擅自一人冲入敌人阵营，否则会死的很快。故玩家的作战策略应该是让友军吸引火力，然后自己绕道敌人侧面或者背面偷袭才能快速的达到消灭敌人的效果。
另一点，作战之时要尽量站在高处，但是那些开阔无掩体的高平台则排除在外。
之后拉动开关，开启炮塔。消灭两大波冲上来的敌人。这里可以先攻击那些运输飞机，可以省去不少力气。
后面大部分的开关都是需要玩家先使用E互动，之后按S拉下
然后来到被困的指挥中心，此时你需要去附近的区域拿取备用能量体重新激活整个防区的系统。这里也是让玩家熟悉操作，后面大部分的门或者机关都需要玩家使用能量体激活开启
后面的战斗没有什么太大的难度。该系列游戏业没有什么岔路或者迷宫之类的场景，玩家只需按照地图指示的方向前进即可。由于本场景大多数时间擎天柱是以一敌多，故多使用远程瞄准的技能来攻击成群出现的敌人
来到下一个平台可以遇到霸王虎派最强的杂病，收割者。这个收割者唯一的弱点就是他背后的喷射器，也是唯一的有效伤害点；正面和侧面对于她的伤害基本都无效。因而玩家的策略就是在他冲刺之后的僵直时间绕道背后集中攻击她的喷射器。而且切记不可与此怪物近战，否则会很容易死亡
注意下图所示的能量柱。通过这些能量柱可以让擎天柱跳跃到高台的区域，后面会出现很多类这样的物体，而且很多是前行的必经途径，玩家一定要留心。
本作也带有一定的解密设定，不过在前面的几个关卡设定的并不是很难
之后来到第二个下图所示高台对付下层出现的装甲坦克，这里就是让玩家熟悉一下各个人物的特殊技能。各个人物的特殊技能在解锁之后可以通过相应的标注按键开启，一般为Q或者F
这里使用擎天柱的Q特殊技能召唤重火炮击毁下层的两个重型坦克即可打开前进的道路
前往方舟的路途到处是一片狼藉。博派在霸王虎的攻击之下，惨败。而身处绝望之时，一个神秘的声音召唤者擎天柱。
本章节后面的路途不是太复杂，但是敌人众多。这里建议玩家以霰弹枪+火箭炮的配置前进
开启防区的最终巨型炮塔，这里消灭掉指定数额的坦克并且保证能源站不被摧毁。剧情进行，此时炮塔突然停止工作
来到炮塔的下层，擎天柱在这里来到一个神秘的区域，启动了猛大帅
第三幕
原来擎天柱在恢复整个方舟周围系统的同时也启动了猛大帅的最终激活系统。于是在这危急时刻擎天柱在猛大帅的帮助之下，决定摧毁攻击方舟的三个巨型炮塔
之后两人分兵前进，擎天柱急速冲到第一个炮塔的区域。而猛大帅则是一路边剿灭敌人边往目标冲击。这里就是让玩家练习一下在变身为机器模式下的操作。左键是攻击，右键一般为冲刺，Q或者F则是特殊技能（如加速）。如果有额外的武器，则可以通过鼠标滚轮切换武器。
在机器模式下，玩家按鼠标右键冲刺同样可以杀死敌人
来到第一个炮塔出，按Q瞄准炮塔之后，再按SPACE即可召唤猛大帅干掉这个炮塔。
这里需要注意的是，游戏的大部分场景都是需要彻底干净消灭整个区域的敌人才能继续推进剧情的，而摧毁炮塔这个任务也是如此。因而如果剧情没有推进的话，玩家可尝试先清扫残余的敌人
之后的路途就很简单了，还是沿着路途一路杀向第二个炮塔。先来到防御据点防守住敌人的轮番进攻。注意这里你可以按Q召唤猛大帅来发射导弹摧毁这些坦克
之后进入对面的神殿内部，推开巨石打开通道，来到第二个炮塔的区域
瞄准炮塔之时不能距离过远，如下图，否则无法召唤猛大帅摧毁
消灭第二个炮塔之后，从旁边的高台阶梯一路向上即可通往最后一个炮塔的路途
但是没有想到的是，在摧毁最后一个炮塔之时，猛大帅此时却突然倒下。而此时的方舟在霸天虎的围攻之下护盾已经彻底失效，接近被摧毁的边缘，情急之下，擎天柱决定一人冲向炮塔
但是刚进入炮塔就中了红蜘蛛的诡计。而擎天柱则被抓到得意洋洋的威震天目前，静待处置。恰巧，此时猛大帅居然又复活了，他打破最后一个炮塔的窗户，再次将威震天砸成了肉泥
而剩余的一帮喽喽见此赶紧吓得四处逃窜，霸天虎也全面溃退。方舟之战就这样戏剧性的暂时结束
第四幕
现在我们将视角切回到另一个故事体系。飞过山和爵士这两对活宝正在擎天柱的秘密指派之下，前往探索一个古老神庙的秘密以及霸天虎在里面的机密行动。
从本关开始，游戏的难度将逐步加大。由于飞过山和爵士这两人的能力远远逊色于擎天柱这样的一流角色，而且本关卡的敌人大多相当强悍，故玩家要学会多利用技能和地形来对付强大的对手
首先在本章节我们操作的是爵士。爵士的特点就是可以隐形，但是隐形状态下会被反隐形部队的扫描光线发现。而且一旦被反隐身激光照射之后，爵士将在一段时间内无法恢复或者使用隐形技能
不过由于爵士变身之后的体型极小，故可以躲避到一些比较小的管道并且敌人无法攻击进入，从而获得暂时的安全。但是在进入管道状态下，爵士是无法使用任何技能的
下图所示的就是本场景的管道设定，这个很重要。往往玩家需要这个暂时躲避敌人的进攻。
另一点要说明的是，本关卡大部分场景无须要消灭所有敌人才可推进剧情。故玩家在某些场景之下可以一路冲过去避免不必要的战斗
先是来到墓地入口的平台，消灭所有的敌人之后打开开关，坐着吊索来到对面的平台
在吊索不要恋战要迅速离开，爵士是在太过于脆弱不能有效对抗为数众多敌人的冲击
下面就是要面对我们的新类型怪物，也是四五两章最难缠的家伙，反隐形机甲。这种怪物在发现你之后将自动缩回头部保护自己，并且向玩家冲击发射火焰弹。对付该怪物的唯一办法就是在他进入警戒扫描模式之后，饶到他的背后攻击她露出的头部，而在他发现玩家的攻击状态下，基本上对他的身体射击是无法造成有效伤害的
之后来到神庙中心发现太阳系的相关资料之后，一路返回墓地入口同擎天柱汇报详细情况。原来霸天虎在这个神迹发现了资源丰富的太阳系中地球的相关资料，准备集中力量去殖民这个新世界。在擎天柱指示之下，两人决定去探查神迹下层发掘最后的真相。后面的路途玩家可以一路沿着管道冲过去，不过还是要注意反隐形机甲的扫描，千万不可被照到，否则会陷入敌人的火力包围攻击之中
之后就是最后一个任务了，同飞过天一起启动推动炸药并且保护她不被敌人击毁。这个战斗难度较大，不过由于敌人会优先攻击炸药车，因而你可趁此干掉成群出现的敌人。战斗必须的补给你可以从杀死的敌人那里获得。两人的努力之下，炸开了霸天虎在神殿之下的秘密研究入口
欢乐游戏吧
